ANALIZA CONFORMATIONALA

Prezentarea pe scurt a programului AMPAC.

Cum desenam in cadrul p 16316u203q rogramului AMPAC? Comparatie cu programul HyperChem.

Ce este "matricea z"? Cum se scrie ea pentru: HCl, H₂O, 1,2- dicloretena. Scopul scrierii matricei z. Discutarea matricei z (tabelul "Atom List").

Se deseneaza molecula (clorura acidului maleic). Identificarea atomilor moleculei clorurii acidului maleic in cadrul matricei z.

Ce este analiza conformationala?

Ce este suprafata de energie potentiala?

Cum se obtine suprafata de energie potentiala? Vom calcula energiile conformatiilor optimizate obtinute prin varierea ungiurilor diedre φ₁ si φ₂, astfel:

- φ₁ : 0 180;

- φ₂ : 0 180 (in notatie Ampac de la +180 la -180);

domeniile au fost alese astfel din considerente de simetrie.

Se optimizeaza geometria moleculei

Pentru fiecare unghi diedru ales, se fixeaza (in matricea z) valorile din mijlocul intervalului ales pentru fiecare unghi diedru. In cazul in care se obtine o geometrie imposibila in urma unei impiedicari sterice, se modica ungiurile respective.

Se efectueaza "Reaction Grid"

Se deschide fisierul "vis" si se vizualizeza filmuletul tuturor conformerilor pentru care s-a calculat energia totala datorata modificarilor celor doua unghiuri diedre.

De ce acest exemplu?